Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CD300CQ08708 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD300CQ08708 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CD300CQ08708 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms