Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
E2F1Q01094 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
E2F1Q01094 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms