Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM4P67936 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM4P67936 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM4P67936 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM4P67936 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM4P67936 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM4P67936 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM4P67936 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM4P67936 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM4P67936 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPM4P67936 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM4P67936 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM4P67936 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM4P67936 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM4P67936 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM4P67936 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM4P67936 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM4P67936 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM4P67936 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM4P67936 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM4P67936 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM4P67936 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM4P67936 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM4P67936 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM4P67936 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM4P67936 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM4P67936 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM4P67936 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM4P67936 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM4P67936 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM4P67936 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM4P67936 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM4P67936 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM4P67936 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPM4P67936 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM4P67936 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM4P67936 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM4P67936 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM4P67936 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM4P67936 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TPM4P67936 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM4P67936 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM4P67936 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM4P67936 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM4P67936 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM4P67936 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM4P67936 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM4P67936 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPM4P67936 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPM4P67936 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPM4P67936 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPM4P67936 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TPM4P67936 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPM4P67936 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPM4P67936 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPM4P67936 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPM4P67936 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPM4P67936 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPM4P67936 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPM4P67936 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPM4P67936 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPM4P67936 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPM4P67936 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPM4P67936 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TPM4P67936 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TPM4P67936 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms