Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH8P55286 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH8P55286 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH8P55286 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH8P55286 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH8P55286 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH8P55286 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH8P55286 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH8P55286 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH8P55286 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH8P55286 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDH8P55286 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH8P55286 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH8P55286 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH8P55286 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH8P55286 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDH8P55286 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH8P55286 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH8P55286 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH8P55286 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH8P55286 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH8P55286 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH8P55286 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH8P55286 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH8P55286 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDH8P55286 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH8P55286 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH8P55286 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH8P55286 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH8P55286 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDH8P55286 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH8P55286 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH8P55286 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH8P55286 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH8P55286 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH8P55286 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH8P55286 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH8P55286 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH8P55286 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH8P55286 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH8P55286 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH8P55286 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDH8P55286 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH8P55286 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDH8P55286 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH8P55286 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH8P55286 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CDH8P55286 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH8P55286 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH8P55286 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH8P55286 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH8P55286 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH8P55286 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH8P55286 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH8P55286 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDH8P55286 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDH8P55286 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDH8P55286 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH8P55286 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH8P55286 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH8P55286 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH8P55286 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH8P55286 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH8P55286 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDH8P55286 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH8P55286 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH8P55286 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH8P55286 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH8P55286 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH8P55286 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDH8P55286 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms