Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDH8P55286 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CDH8P55286 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
CDH8P55286 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CDH8P55286 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CDH8P55286 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CDH8P55286 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CDH8P55286 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CDH8P55286 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CDH8P55286 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CDH8P55286 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CDH8P55286 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CDH8P55286 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CDH8P55286 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CDH8P55286 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CDH8P55286 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CDH8P55286 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CDH8P55286 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CDH8P55286 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CDH8P55286 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CDH8P55286 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CDH8P55286 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CDH8P55286 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CDH8P55286 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDH8P55286 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CDH8P55286 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CDH8P55286 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CDH8P55286 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CDH8P55286 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CDH8P55286 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CDH8P55286 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CDH8P55286 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CDH8P55286 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDH8P55286 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CDH8P55286 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CDH8P55286 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CDH8P55286 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDH8P55286 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CDH8P55286 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CDH8P55286 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CDH8P55286 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDH8P55286 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CDH8P55286 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CDH8P55286 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDH8P55286 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDH8P55286 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDH8P55286 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDH8P55286 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDH8P55286 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CDH8P55286 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDH8P55286 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CDH8P55286 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CDH8P55286 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CDH8P55286 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CDH8P55286 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDH8P55286 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDH8P55286 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDH8P55286 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CDH8P55286 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CDH8P55286 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CDH8P55286 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CDH8P55286 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CDH8P55286 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CDH8P55286 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
CDH8P55286 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CDH8P55286 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDH8P55286 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDH8P55286 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDH8P55286 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CDH8P55286 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDH8P55286 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDH8P55286 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDH8P55286 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
CDH8P55286 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDH8P55286 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CDH8P55286 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDH8P55286 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CDH8P55286 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDH8P55286 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDH8P55286 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CDH8P55286 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDH8P55286 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CDH8P55286 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDH8P55286 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CDH8P55286 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDH8P55286 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CDH8P55286 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDH8P55286 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CDH8P55286 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDH8P55286 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CDH8P55286 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CDH8P55286 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CDH8P55286 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDH8P55286 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CDH8P55286 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
CDH8P55286 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDH8P55286 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CDH8P55286 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CDH8P55286 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CDH8P55286 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms