Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST1P52848 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST1P52848 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST1P52848 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST1P52848 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST1P52848 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NDST1P52848 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST1P52848 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST1P52848 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST1P52848 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST1P52848 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST1P52848 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST1P52848 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NDST1P52848 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDST1P52848 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NDST1P52848 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST1P52848 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST1P52848 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST1P52848 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST1P52848 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST1P52848 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST1P52848 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST1P52848 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST1P52848 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST1P52848 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST1P52848 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST1P52848 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NDST1P52848 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NDST1P52848 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDST1P52848 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDST1P52848 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NDST1P52848 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDST1P52848 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDST1P52848 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NDST1P52848 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST1P52848 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST1P52848 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST1P52848 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST1P52848 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST1P52848 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST1P52848 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST1P52848 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST1P52848 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NDST1P52848 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST1P52848 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST1P52848 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST1P52848 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST1P52848 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST1P52848 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST1P52848 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST1P52848 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST1P52848 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST1P52848 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST1P52848 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NDST1P52848 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST1P52848 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST1P52848 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST1P52848 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST1P52848 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NDST1P52848 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST1P52848 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST1P52848 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST1P52848 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST1P52848 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST1P52848 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST1P52848 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST1P52848 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST1P52848 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NDST1P52848 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDST1P52848 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDST1P52848 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NDST1P52848 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDST1P52848 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDST1P52848 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDST1P52848 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDST1P52848 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDST1P52848 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDST1P52848 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDST1P52848 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NDST1P52848 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NDST1P52848 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST1P52848 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST1P52848 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST1P52848 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST1P52848 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST1P52848 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST1P52848 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NDST1P52848 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms