Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB3O75712 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB3O75712 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB3O75712 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GJB3O75712 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB3O75712 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB3O75712 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB3O75712 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB3O75712 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB3O75712 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GJB3O75712 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB3O75712 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB3O75712 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB3O75712 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB3O75712 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB3O75712 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GJB3O75712 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB3O75712 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB3O75712 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB3O75712 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB3O75712 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB3O75712 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB3O75712 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GJB3O75712 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB3O75712 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB3O75712 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB3O75712 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB3O75712 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB3O75712 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB3O75712 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GJB3O75712 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GJB3O75712 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GJB3O75712 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB3O75712 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB3O75712 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB3O75712 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB3O75712 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB3O75712 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB3O75712 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB3O75712 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB3O75712 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB3O75712 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB3O75712 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB3O75712 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB3O75712 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB3O75712 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB3O75712 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB3O75712 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB3O75712 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB3O75712 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB3O75712 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB3O75712 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB3O75712 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB3O75712 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB3O75712 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB3O75712 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB3O75712 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB3O75712 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB3O75712 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB3O75712 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB3O75712 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB3O75712 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB3O75712 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB3O75712 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB3O75712 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB3O75712 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB3O75712 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB3O75712 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB3O75712 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB3O75712 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB3O75712 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB3O75712 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms