Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNDIG1LA6NDD5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SYNDIG1LA6NDD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms