Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LINC00474Q9P2X8 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms