Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPRJQ12913 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPRJQ12913 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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