Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PTPRJQ12913 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRJQ12913 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PTPRJQ12913 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
PTPRJQ12913 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRJQ12913 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRJQ12913 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PTPRJQ12913 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PTPRJQ12913 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRJQ12913 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRJQ12913 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PTPRJQ12913 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRJQ12913 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
PTPRJQ12913 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PTPRJQ12913 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTPRJQ12913 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRJQ12913 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRJQ12913 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PTPRJQ12913 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
PTPRJQ12913 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PTPRJQ12913 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTPRJQ12913 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTPRJQ12913 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTPRJQ12913 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRJQ12913 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRJQ12913 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRJQ12913 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PTPRJQ12913 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PTPRJQ12913 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRJQ12913 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRJQ12913 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRJQ12913 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRJQ12913 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRJQ12913 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRJQ12913 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRJQ12913 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRJQ12913 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PTPRJQ12913 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PTPRJQ12913 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PTPRJQ12913 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PTPRJQ12913 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PTPRJQ12913 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRJQ12913 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
PTPRJQ12913 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRJQ12913 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRJQ12913 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
PTPRJQ12913 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PTPRJQ12913 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PTPRJQ12913 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRJQ12913 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
PTPRJQ12913 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PTPRJQ12913 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
PTPRJQ12913 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PTPRJQ12913 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PTPRJQ12913 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRJQ12913 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRJQ12913 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRJQ12913 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRJQ12913 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRJQ12913 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PTPRJQ12913 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PTPRJQ12913 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PTPRJQ12913 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPRJQ12913 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PTPRJQ12913 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPRJQ12913 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPRJQ12913 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPRJQ12913 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32■■■□□ 2.71
PTPRJQ12913 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPRJQ12913 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRJQ12913 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PTPRJQ12913 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPRJQ12913 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PTPRJQ12913 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPRJQ12913 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPRJQ12913 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPRJQ12913 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPRJQ12913 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRJQ12913 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPRJQ12913 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPRJQ12913 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPRJQ12913 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPRJQ12913 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPRJQ12913 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPRJQ12913 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTPRJQ12913 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPRJQ12913 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPRJQ12913 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRJQ12913 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPRJQ12913 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPRJQ12913 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPRJQ12913 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PTPRJQ12913 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRJQ12913 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPRJQ12913 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPRJQ12913 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRJQ12913 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPRJQ12913 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTPRJQ12913 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PTPRJQ12913 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
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