Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
IL3RAP26951 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms