Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD3-206ENST00000603524 742 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD3-211ENST00000604804 564 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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