Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC58.87■■■■■ 7.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC58.17■■■■■ 6.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.43■■■■■ 6.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC57.32■■■■■ 6.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.98■■■■■ 6.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.71■■■■■ 6.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.6■■■■■ 6.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC56.31■■■■■ 6.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.61■■■■■ 6.49
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC55.48■■■■■ 6.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC55.47■■■■■ 6.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC55.46■■■■■ 6.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.07■■■■■ 6.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.07■■■■■ 6.41
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.04■■■■■ 6.4
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC54.85■■■■■ 6.37
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC54.71■■■■■ 6.35
BIVM-ERCC5R4GMW8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC54.62■■■■■ 6.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.57■■■■■ 6.33
BIVM-ERCC5R4GMW8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.36■■■■■ 6.29
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC54.06■■■■■ 6.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.06■■■■■ 6.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.04■■■■■ 6.24
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC53.9■■■■■ 6.22
BIVM-ERCC5R4GMW8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.73■■■■■ 6.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC53.72■■■■■ 6.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC53.61■■■■■ 6.17
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC53.42■■■■■ 6.14
BIVM-ERCC5R4GMW8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC53.35■■■■■ 6.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.33■■■■■ 6.13
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.22■■■■■ 6.11
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC52.95■■■■■ 6.07
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.92■■■■■ 6.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC52.89■■■■■ 6.06
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC52.79■■■■■ 6.04
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC52.66■■■■■ 6.02
BIVM-ERCC5R4GMW8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC52.61■■■■■ 6.01
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC52.53■■■■■ 6
BIVM-ERCC5R4GMW8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC52.4■■■■■ 5.98
BIVM-ERCC5R4GMW8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.25■■■■■ 5.95
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.12■■■■■ 5.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC52.04■■■■■ 5.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.01■■■■■ 5.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC51.97■■■■■ 5.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC51.74■■■■■ 5.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC51.69■■■■■ 5.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC51.35■■■■■ 5.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC51.31■■■■■ 5.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.29■■■■■ 5.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.28■■■■■ 5.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
BIVM-ERCC5R4GMW8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.07■■■■■ 5.77
BIVM-ERCC5R4GMW8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.99■■■■■ 5.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC50.97■■■■■ 5.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC50.95■■■■■ 5.75
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC50.93■■■■■ 5.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC50.91■■■■■ 5.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.86■■■■■ 5.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.84■■■■■ 5.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC50.79■■■■■ 5.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC50.79■■■■■ 5.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC50.77■■■■■ 5.72
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC50.74■■■■■ 5.71
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.65■■■■■ 5.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.65■■■■■ 5.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.63■■■■■ 5.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.63■■■■■ 5.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC50.58■■■■■ 5.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.57■■■■■ 5.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.56■■■■■ 5.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC50.55■■■■■ 5.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC50.52■■■■■ 5.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.5■■■■■ 5.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC50.45■■■■■ 5.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.45■■■■■ 5.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC50.39■■■■■ 5.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.37■■■■■ 5.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC50.37■■■■■ 5.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.36■■■■■ 5.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC50.34■■■■■ 5.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.29■■■■■ 5.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC50.26■■■■■ 5.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.14■■■■■ 5.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.02■■■■■ 5.6
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC50■■■■■ 5.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC49.99■■■■■ 5.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC49.97■■■■■ 5.59
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC49.97■■■■■ 5.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms