Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C9orf16Q9BUW7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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C9orf16Q9BUW7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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C9orf16Q9BUW7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
C9orf16Q9BUW7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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