Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 BRWD1-204ENST00000380800 7605 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FOXD4Q12950 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms