Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CALCOCO1Q9P1Z2 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CALCOCO1Q9P1Z2 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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