Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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FOXE3Q13461 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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FOXE3Q13461 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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FOXE3Q13461 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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