RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263054.10

SORCS1-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SORCS1, Length 7,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SORCS1-201ENST00000263054 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
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SORCS1-201ENST00000263054 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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SORCS1-201ENST00000263054 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
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SORCS1-201ENST00000263054 ARID3CA6NKF2 412 aa20.49■□□□□ 0.87
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SORCS1-201ENST00000263054 TONSLQ96HA7 1378 aa19.42■□□□□ 0.7
SORCS1-201ENST00000263054 TMC1Q8TDI8 760 aa19.39■□□□□ 0.69
SORCS1-201ENST00000263054 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.36■□□□□ 0.69
SORCS1-201ENST00000263054 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
SORCS1-201ENST00000263054 KCNH8Q96L42 1107 aa19.33■□□□□ 0.68
SORCS1-201ENST00000263054 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
SORCS1-201ENST00000263054 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
SORCS1-201ENST00000263054 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
SORCS1-201ENST00000263054 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.29■□□□□ 0.68
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