RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263054.10

SORCS1-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SORCS1, Length 7,272 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-201ENST00000263054 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.52■■□□□ 1.68
SORCS1-201ENST00000263054 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.01■■□□□ 1.43
SORCS1-201ENST00000263054 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
SORCS1-201ENST00000263054 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.44■■□□□ 1.34
SORCS1-201ENST00000263054 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SORCS1-201ENST00000263054 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SORCS1-201ENST00000263054 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SORCS1-201ENST00000263054 APLP2Q06481 763 aa22.7■■□□□ 1.22
SORCS1-201ENST00000263054 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
SORCS1-201ENST00000263054 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SORCS1-201ENST00000263054 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.35■■□□□ 1.17
SORCS1-201ENST00000263054 NISCHQ9Y2I1 1504 aa22.23■■□□□ 1.15
SORCS1-201ENST00000263054 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.22■■□□□ 1.15
SORCS1-201ENST00000263054 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SORCS1-201ENST00000263054 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SORCS1-201ENST00000263054 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
SORCS1-201ENST00000263054 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.82■■□□□ 1.08
SORCS1-201ENST00000263054 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SORCS1-201ENST00000263054 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.78■■□□□ 1.08
SORCS1-201ENST00000263054 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SORCS1-201ENST00000263054 TRIM41Q8WV44 630 aa21.71■■□□□ 1.07
SORCS1-201ENST00000263054 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.69■■□□□ 1.06
SORCS1-201ENST00000263054 MYT1Q01538 1121 aa21.65■■□□□ 1.06
SORCS1-201ENST00000263054 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
SORCS1-201ENST00000263054 ITGAEP38570 1179 aa21.54■■□□□ 1.04
SORCS1-201ENST00000263054 NEFLP07196 543 aa21.52■■□□□ 1.04
SORCS1-201ENST00000263054 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SORCS1-201ENST00000263054 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SORCS1-201ENST00000263054 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SORCS1-201ENST00000263054 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SORCS1-201ENST00000263054 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
SORCS1-201ENST00000263054 BCL11AQ9H165 835 aa20.95■□□□□ 0.94
SORCS1-201ENST00000263054 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa20.88■□□□□ 0.93
SORCS1-201ENST00000263054 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.85■□□□□ 0.93
SORCS1-201ENST00000263054 SLC24A1O60721 1099 aa20.85■□□□□ 0.93
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
SORCS1-201ENST00000263054 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
SORCS1-201ENST00000263054 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
SORCS1-201ENST00000263054 NEUROD1Q13562 356 aa20.65■□□□□ 0.9
SORCS1-201ENST00000263054 TRIM52Q96A61 297 aa20.64■□□□□ 0.9
SORCS1-201ENST00000263054 HRCP23327 699 aa20.62■□□□□ 0.89
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SORCS1-201ENST00000263054 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS1-201ENST00000263054 BCANQ96GW7 911 aa20.6■□□□□ 0.89
SORCS1-201ENST00000263054 FBLN2P98095 1184 aa20.57■□□□□ 0.88
SORCS1-201ENST00000263054 ARID3CA6NKF2 412 aa20.49■□□□□ 0.87
SORCS1-201ENST00000263054 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.87
SORCS1-201ENST00000263054 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SORCS1-201ENST00000263054 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SORCS1-201ENST00000263054 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
SORCS1-201ENST00000263054 CANXP27824 592 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SORCS1-201ENST00000263054 P3H3Q8IVL6 736 aa20.25■□□□□ 0.83
SORCS1-201ENST00000263054 ABCC9O60706 1549 aa20.15■□□□□ 0.82
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SORCS1-201ENST00000263054 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SORCS1-201ENST00000263054 ANP32CO43423 234 aa20.09■□□□□ 0.81
SORCS1-201ENST00000263054 PLEKHG5O94827 1062 aa20.08■□□□□ 0.81
SORCS1-201ENST00000263054 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SORCS1-201ENST00000263054 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SORCS1-201ENST00000263054 NEFMP07197 916 aa20.02■□□□□ 0.8
SORCS1-201ENST00000263054 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
SORCS1-201ENST00000263054 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SORCS1-201ENST00000263054 A0A0G2JS52 829 aa19.99■□□□□ 0.79
SORCS1-201ENST00000263054 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa19.98■□□□□ 0.79
SORCS1-201ENST00000263054 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
SORCS1-201ENST00000263054 STAG3Q9UJ98 1225 aa19.95■□□□□ 0.78
SORCS1-201ENST00000263054 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
SORCS1-201ENST00000263054 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.81■□□□□ 0.76
SORCS1-201ENST00000263054 ARXQ96QS3 562 aa19.81■□□□□ 0.76
SORCS1-201ENST00000263054 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.76
SORCS1-201ENST00000263054 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
SORCS1-201ENST00000263054 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SORCS1-201ENST00000263054 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.68■□□□□ 0.74
SORCS1-201ENST00000263054 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
SORCS1-201ENST00000263054 C14orf37Q86TY3 774 aa19.61■□□□□ 0.73
SORCS1-201ENST00000263054 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa19.6■□□□□ 0.73
SORCS1-201ENST00000263054 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SORCS1-201ENST00000263054 CHIC2Q9UKJ5 165 aa19.6■□□□□ 0.73
SORCS1-201ENST00000263054 FKBP8Q14318 412 aa19.58■□□□□ 0.72
SORCS1-201ENST00000263054 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa19.57■□□□□ 0.72
SORCS1-201ENST00000263054 NBR1Q14596 966 aa19.56■□□□□ 0.72
SORCS1-201ENST00000263054 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP19.53■□□□□ 0.72
SORCS1-201ENST00000263054 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
SORCS1-201ENST00000263054 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP19.51■□□□□ 0.71
SORCS1-201ENST00000263054 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
SORCS1-201ENST00000263054 TPRNQ4KMQ1 711 aa19.5■□□□□ 0.71
SORCS1-201ENST00000263054 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
SORCS1-201ENST00000263054 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
SORCS1-201ENST00000263054 TAOK2Q9UL54 1235 aa19.44■□□□□ 0.7
SORCS1-201ENST00000263054 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
SORCS1-201ENST00000263054 SCRIBQ14160 1630 aa19.42■□□□□ 0.7
SORCS1-201ENST00000263054 TONSLQ96HA7 1378 aa19.42■□□□□ 0.7
SORCS1-201ENST00000263054 TMC1Q8TDI8 760 aa19.39■□□□□ 0.69
SORCS1-201ENST00000263054 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.36■□□□□ 0.69
SORCS1-201ENST00000263054 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP19.35■□□□□ 0.69
SORCS1-201ENST00000263054 KCNH8Q96L42 1107 aa19.33■□□□□ 0.68
SORCS1-201ENST00000263054 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
SORCS1-201ENST00000263054 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
SORCS1-201ENST00000263054 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
SORCS1-201ENST00000263054 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms