Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms