Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TCIRG1Q13488 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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