Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJB2P29033 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GJB2P29033 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJB2P29033 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GJB2P29033 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms