RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336283.7

SRA1-201, Transcript of steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRA1, Length 2,107 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1-201ENST00000336283 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.17■■■□□ 2.42
SRA1-201ENST00000336283 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.9■■□□□ 1.74
SRA1-201ENST00000336283 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
SRA1-201ENST00000336283 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.21■■□□□ 1.63
SRA1-201ENST00000336283 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.9■■□□□ 1.58
SRA1-201ENST00000336283 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.82■■□□□ 1.56
SRA1-201ENST00000336283 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SRA1-201ENST00000336283 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.33■■□□□ 1.49
SRA1-201ENST00000336283 SCRIBQ14160 1630 aa24■■□□□ 1.43
SRA1-201ENST00000336283 NACADO15069 1562 aa24■■□□□ 1.43
SRA1-201ENST00000336283 ABCC9O60706 1549 aa23.98■■□□□ 1.43
SRA1-201ENST00000336283 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.92■■□□□ 1.42
SRA1-201ENST00000336283 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SRA1-201ENST00000336283 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.63■■□□□ 1.37
SRA1-201ENST00000336283 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.43■■□□□ 1.34
SRA1-201ENST00000336283 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.36■■□□□ 1.33
SRA1-201ENST00000336283 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
SRA1-201ENST00000336283 WIZO95785 1651 aa23.2■■□□□ 1.3
SRA1-201ENST00000336283 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.19■■□□□ 1.3
SRA1-201ENST00000336283 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.08■■□□□ 1.28
SRA1-201ENST00000336283 TRIM41Q8WV44 630 aa23.07■■□□□ 1.28
SRA1-201ENST00000336283 SMARCA4P51532 1647 aa23.03■■□□□ 1.28
SRA1-201ENST00000336283 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SRA1-201ENST00000336283 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.93■■□□□ 1.26
SRA1-201ENST00000336283 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SRA1-201ENST00000336283 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SRA1-201ENST00000336283 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.77■■□□□ 1.24
SRA1-201ENST00000336283 SMARCA2P51531 1590 aa22.77■■□□□ 1.23
SRA1-201ENST00000336283 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.76■■□□□ 1.23
SRA1-201ENST00000336283 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
SRA1-201ENST00000336283 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.7■■□□□ 1.22
SRA1-201ENST00000336283 HRCP23327 699 aa22.67■■□□□ 1.22
SRA1-201ENST00000336283 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SRA1-201ENST00000336283 ABCC8Q09428 1581 aa22.52■■□□□ 1.2
SRA1-201ENST00000336283 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.5■■□□□ 1.19
SRA1-201ENST00000336283 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SRA1-201ENST00000336283 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.39■■□□□ 1.17
SRA1-201ENST00000336283 EEA1Q15075 1411 aa22.32■■□□□ 1.16
SRA1-201ENST00000336283 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
SRA1-201ENST00000336283 SOGA1O94964 1423 aa22.27■■□□□ 1.16
SRA1-201ENST00000336283 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.19■■□□□ 1.14
SRA1-201ENST00000336283 NCAPD3P42695 1498 aa22.18■■□□□ 1.14
SRA1-201ENST00000336283 HMGXB3Q12766 1538 aa22.17■■□□□ 1.14
SRA1-201ENST00000336283 SYNJ1O43426 1573 aa22.15■■□□□ 1.14
SRA1-201ENST00000336283 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.15■■□□□ 1.14
SRA1-201ENST00000336283 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.15■■□□□ 1.14
SRA1-201ENST00000336283 CEP162Q5TB80 1403 aa22.07■■□□□ 1.12
SRA1-201ENST00000336283 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SRA1-201ENST00000336283 GOLGA3Q08378 1498 aa22.05■■□□□ 1.12
SRA1-201ENST00000336283 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SRA1-201ENST00000336283 UBTFP17480 764 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SRA1-201ENST00000336283 TOP2BQ02880 1626 aa21.99■■□□□ 1.11
SRA1-201ENST00000336283 KIF21BO75037 1637 aa21.98■■□□□ 1.11
SRA1-201ENST00000336283 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.97■■□□□ 1.11
SRA1-201ENST00000336283 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.94■■□□□ 1.1
SRA1-201ENST00000336283 CFTRP13569 1480 aa21.89■■□□□ 1.09
SRA1-201ENST00000336283 CUX1P39880 1505 aa21.79■■□□□ 1.08
SRA1-201ENST00000336283 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.77■■□□□ 1.08
SRA1-201ENST00000336283 PRDM2Q13029 1718 aa21.75■■□□□ 1.07
SRA1-201ENST00000336283 CLIP1P30622 1438 aa21.75■■□□□ 1.07
SRA1-201ENST00000336283 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.7■■□□□ 1.06
SRA1-201ENST00000336283 PRXQ9BXM0 1461 aa21.69■■□□□ 1.06
SRA1-201ENST00000336283 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.69■■□□□ 1.06
SRA1-201ENST00000336283 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.68■■□□□ 1.06
SRA1-201ENST00000336283 KIF27Q86VH2 1401 aa21.66■■□□□ 1.06
SRA1-201ENST00000336283 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.65■■□□□ 1.06
SRA1-201ENST00000336283 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SRA1-201ENST00000336283 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SRA1-201ENST00000336283 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SRA1-201ENST00000336283 APLP2Q06481 763 aa21.5■■□□□ 1.03
SRA1-201ENST00000336283 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SRA1-201ENST00000336283 CUX2O14529 1486 aa21.45■■□□□ 1.02
SRA1-201ENST00000336283 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.44■■□□□ 1.02
SRA1-201ENST00000336283 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.44■■□□□ 1.02
SRA1-201ENST00000336283 ARAP1Q96P48 1450 aa21.43■■□□□ 1.02
SRA1-201ENST00000336283 IGF1RP08069 1367 aa21.43■■□□□ 1.02
SRA1-201ENST00000336283 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.34■■□□□ 1.01
SRA1-201ENST00000336283 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.33■■□□□ 1
SRA1-201ENST00000336283 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.31■■□□□ 1
SRA1-201ENST00000336283 TOPBP1Q92547 1522 aa21.28■■□□□ 1
SRA1-201ENST00000336283 NESP48681 1621 aa21.28■■□□□ 1
SRA1-201ENST00000336283 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.27■■□□□ 1
SRA1-201ENST00000336283 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
SRA1-201ENST00000336283 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.25■□□□□ 0.99
SRA1-201ENST00000336283 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SRA1-201ENST00000336283 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.21■□□□□ 0.99
SRA1-201ENST00000336283 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
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SRA1-201ENST00000336283 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.13■□□□□ 0.97
SRA1-201ENST00000336283 MAP3K1Q13233 1512 aa21.12■□□□□ 0.97
SRA1-201ENST00000336283 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SRA1-201ENST00000336283 CUL7Q14999 1698 aa21.11■□□□□ 0.97
SRA1-201ENST00000336283 WDR97A6NE52 1622 aa21.08■□□□□ 0.97
SRA1-201ENST00000336283 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.06■□□□□ 0.96
SRA1-201ENST00000336283 TIAM1Q13009 1591 aa21.05■□□□□ 0.96
SRA1-201ENST00000336283 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.02■□□□□ 0.96
SRA1-201ENST00000336283 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.01■□□□□ 0.95
SRA1-201ENST00000336283 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.01■□□□□ 0.95
SRA1-201ENST00000336283 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21■□□□□ 0.95
SRA1-201ENST00000336283 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.99■□□□□ 0.95
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