RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292199.6

NLRX1-201, Transcript of NLR family member X1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRX1, Length 3,744 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1-201ENST00000292199 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.22■■■□□ 2.27
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NLRX1-201ENST00000292199 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.91■■□□□ 1.74
NLRX1-201ENST00000292199 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.64
NLRX1-201ENST00000292199 ABCC9O60706 1549 aa24.52■■□□□ 1.52
NLRX1-201ENST00000292199 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.48■■□□□ 1.51
NLRX1-201ENST00000292199 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
NLRX1-201ENST00000292199 EHMT2Q96KQ7 1210 aa23.91■■□□□ 1.42
NLRX1-201ENST00000292199 SCRIBQ14160 1630 aa23.79■■□□□ 1.4
NLRX1-201ENST00000292199 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
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NLRX1-201ENST00000292199 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.63■■□□□ 1.37
NLRX1-201ENST00000292199 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.41■■□□□ 1.34
NLRX1-201ENST00000292199 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.37■■□□□ 1.33
NLRX1-201ENST00000292199 TRIM41Q8WV44 630 aa23.33■■□□□ 1.33
NLRX1-201ENST00000292199 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.2■■□□□ 1.3
NLRX1-201ENST00000292199 NACADO15069 1562 aa23.16■■□□□ 1.3
NLRX1-201ENST00000292199 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
NLRX1-201ENST00000292199 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.08■■□□□ 1.29
NLRX1-201ENST00000292199 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.02■■□□□ 1.28
NLRX1-201ENST00000292199 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.94■■□□□ 1.26
NLRX1-201ENST00000292199 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
NLRX1-201ENST00000292199 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.88■■□□□ 1.25
NLRX1-201ENST00000292199 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NLRX1-201ENST00000292199 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
NLRX1-201ENST00000292199 WIZO95785 1651 aa22.65■■□□□ 1.22
NLRX1-201ENST00000292199 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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NLRX1-201ENST00000292199 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.33■■□□□ 1.17
NLRX1-201ENST00000292199 SMARCA4P51532 1647 aa22.26■■□□□ 1.15
NLRX1-201ENST00000292199 ABCC8Q09428 1581 aa22.25■■□□□ 1.15
NLRX1-201ENST00000292199 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.21■■□□□ 1.15
NLRX1-201ENST00000292199 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NLRX1-201ENST00000292199 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.2■■□□□ 1.14
NLRX1-201ENST00000292199 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
NLRX1-201ENST00000292199 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.14■■□□□ 1.13
NLRX1-201ENST00000292199 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NLRX1-201ENST00000292199 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.09■■□□□ 1.13
NLRX1-201ENST00000292199 SOGA1O94964 1423 aa22.07■■□□□ 1.12
NLRX1-201ENST00000292199 APLP2Q06481 763 aa22.01■■□□□ 1.11
NLRX1-201ENST00000292199 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
NLRX1-201ENST00000292199 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
NLRX1-201ENST00000292199 SMARCA2P51531 1590 aa21.98■■□□□ 1.11
NLRX1-201ENST00000292199 HRCP23327 699 aa21.97■■□□□ 1.11
NLRX1-201ENST00000292199 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.92■■□□□ 1.1
NLRX1-201ENST00000292199 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.85■■□□□ 1.09
NLRX1-201ENST00000292199 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
NLRX1-201ENST00000292199 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NLRX1-201ENST00000292199 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NLRX1-201ENST00000292199 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NLRX1-201ENST00000292199 P3H3Q8IVL6 736 aa21.78■■□□□ 1.08
NLRX1-201ENST00000292199 ITGAEP38570 1179 aa21.71■■□□□ 1.07
NLRX1-201ENST00000292199 CEP162Q5TB80 1403 aa21.66■■□□□ 1.06
NLRX1-201ENST00000292199 NCAPD3P42695 1498 aa21.59■■□□□ 1.05
NLRX1-201ENST00000292199 SYNJ1O43426 1573 aa21.51■■□□□ 1.03
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NLRX1-201ENST00000292199 NESP48681 1621 aa21.46■■□□□ 1.03
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NLRX1-201ENST00000292199 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.44■■□□□ 1.02
NLRX1-201ENST00000292199 EEA1Q15075 1411 aa21.44■■□□□ 1.02
NLRX1-201ENST00000292199 CUX2O14529 1486 aa21.42■■□□□ 1.02
NLRX1-201ENST00000292199 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.42■■□□□ 1.02
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NLRX1-201ENST00000292199 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.39■■□□□ 1.01
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NLRX1-201ENST00000292199 HMGXB3Q12766 1538 aa21.28■■□□□ 1
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NLRX1-201ENST00000292199 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.26■□□□□ 0.99
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NLRX1-201ENST00000292199 FHOD3Q2V2M9 1422 aa20.93■□□□□ 0.94
NLRX1-201ENST00000292199 TOPBP1Q92547 1522 aa20.92■□□□□ 0.94
NLRX1-201ENST00000292199 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
NLRX1-201ENST00000292199 KIF21BO75037 1637 aa20.9■□□□□ 0.94
NLRX1-201ENST00000292199 ARAP1Q96P48 1450 aa20.89■□□□□ 0.94
NLRX1-201ENST00000292199 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
NLRX1-201ENST00000292199 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.88■□□□□ 0.93
NLRX1-201ENST00000292199 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
NLRX1-201ENST00000292199 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
NLRX1-201ENST00000292199 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.8■□□□□ 0.92
NLRX1-201ENST00000292199 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.8■□□□□ 0.92
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