Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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