RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390357.3

TRBV4-1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 4-1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRBV4-1, Length 373 nt, Biotype TR V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV4-1-201ENST00000390357 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.6■■■□□ 2.97
TRBV4-1-201ENST00000390357 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.09■■■□□ 2.41
TRBV4-1-201ENST00000390357 ABCC9O60706 1549 aa29.77■■■□□ 2.36
TRBV4-1-201ENST00000390357 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.55■■■□□ 2.16
TRBV4-1-201ENST00000390357 NACADO15069 1562 aa28.44■■■□□ 2.14
TRBV4-1-201ENST00000390357 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.29■■■□□ 2.12
TRBV4-1-201ENST00000390357 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.16■■■□□ 2.1
TRBV4-1-201ENST00000390357 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TRBV4-1-201ENST00000390357 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.84■■■□□ 2.05
TRBV4-1-201ENST00000390357 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.82■■■□□ 2.04
TRBV4-1-201ENST00000390357 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
TRBV4-1-201ENST00000390357 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.74■■■□□ 2.03
TRBV4-1-201ENST00000390357 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.6■■■□□ 2.01
TRBV4-1-201ENST00000390357 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.42■■□□□ 1.98
TRBV4-1-201ENST00000390357 SCRIBQ14160 1630 aa27.3■■□□□ 1.96
TRBV4-1-201ENST00000390357 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TRBV4-1-201ENST00000390357 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.94■■□□□ 1.9
TRBV4-1-201ENST00000390357 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.85■■□□□ 1.89
TRBV4-1-201ENST00000390357 NCAPD3P42695 1498 aa26.24■■□□□ 1.79
TRBV4-1-201ENST00000390357 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.13■■□□□ 1.77
TRBV4-1-201ENST00000390357 SMARCA4P51532 1647 aa26.13■■□□□ 1.77
TRBV4-1-201ENST00000390357 SMARCA2P51531 1590 aa26.12■■□□□ 1.77
TRBV4-1-201ENST00000390357 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
TRBV4-1-201ENST00000390357 HMGXB3Q12766 1538 aa26.02■■□□□ 1.76
TRBV4-1-201ENST00000390357 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.94■■□□□ 1.74
TRBV4-1-201ENST00000390357 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
TRBV4-1-201ENST00000390357 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.82■■□□□ 1.72
TRBV4-1-201ENST00000390357 ERCC6Q03468 1493 aa25.75■■□□□ 1.71
TRBV4-1-201ENST00000390357 CUX2O14529 1486 aa25.69■■□□□ 1.7
TRBV4-1-201ENST00000390357 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.61■■□□□ 1.69
TRBV4-1-201ENST00000390357 NESP48681 1621 aa25.6■■□□□ 1.69
TRBV4-1-201ENST00000390357 WIZO95785 1651 aa25.52■■□□□ 1.68
TRBV4-1-201ENST00000390357 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.48■■□□□ 1.67
TRBV4-1-201ENST00000390357 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.46■■□□□ 1.67
TRBV4-1-201ENST00000390357 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.44■■□□□ 1.66
TRBV4-1-201ENST00000390357 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
TRBV4-1-201ENST00000390357 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
TRBV4-1-201ENST00000390357 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.32■■□□□ 1.64
TRBV4-1-201ENST00000390357 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TRBV4-1-201ENST00000390357 CFTRP13569 1480 aa25.18■■□□□ 1.62
TRBV4-1-201ENST00000390357 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.16■■□□□ 1.62
TRBV4-1-201ENST00000390357 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.12■■□□□ 1.61
TRBV4-1-201ENST00000390357 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.1■■□□□ 1.61
TRBV4-1-201ENST00000390357 WDR62O43379 1518 aa25.09■■□□□ 1.61
TRBV4-1-201ENST00000390357 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.97■■□□□ 1.59
TRBV4-1-201ENST00000390357 PRDM2Q13029 1718 aa24.95■■□□□ 1.58
TRBV4-1-201ENST00000390357 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
TRBV4-1-201ENST00000390357 ABCC8Q09428 1581 aa24.76■■□□□ 1.55
TRBV4-1-201ENST00000390357 IFT140Q96RY7 1462 aa24.64■■□□□ 1.54
TRBV4-1-201ENST00000390357 TOPBP1Q92547 1522 aa24.64■■□□□ 1.53
TRBV4-1-201ENST00000390357 OSCARQ8IYS5 282 aa24.62■■□□□ 1.53
TRBV4-1-201ENST00000390357 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.58■■□□□ 1.52
TRBV4-1-201ENST00000390357 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
TRBV4-1-201ENST00000390357 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TRBV4-1-201ENST00000390357 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
TRBV4-1-201ENST00000390357 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TRBV4-1-201ENST00000390357 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TRBV4-1-201ENST00000390357 SOGA1O94964 1423 aa24.35■■□□□ 1.49
TRBV4-1-201ENST00000390357 TRIM41Q8WV44 630 aa24.32■■□□□ 1.48
TRBV4-1-201ENST00000390357 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
TRBV4-1-201ENST00000390357 WDR97A6NE52 1622 aa24.28■■□□□ 1.48
TRBV4-1-201ENST00000390357 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.26■■□□□ 1.47
TRBV4-1-201ENST00000390357 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.26■■□□□ 1.47
TRBV4-1-201ENST00000390357 CUX1P39880 1505 aa24.25■■□□□ 1.47
TRBV4-1-201ENST00000390357 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TRBV4-1-201ENST00000390357 FBLN2P98095 1184 aa24.17■■□□□ 1.46
TRBV4-1-201ENST00000390357 CHD1O14646 1710 aa24.15■■□□□ 1.46
TRBV4-1-201ENST00000390357 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.13■■□□□ 1.45
TRBV4-1-201ENST00000390357 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.13■■□□□ 1.45
TRBV4-1-201ENST00000390357 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.13■■□□□ 1.45
TRBV4-1-201ENST00000390357 GRIN2BQ13224 1484 aa24.11■■□□□ 1.45
TRBV4-1-201ENST00000390357 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TRBV4-1-201ENST00000390357 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TRBV4-1-201ENST00000390357 ARHGEF11O15085 1522 aa24.08■■□□□ 1.45
TRBV4-1-201ENST00000390357 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.06■■□□□ 1.44
TRBV4-1-201ENST00000390357 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.05■■□□□ 1.44
TRBV4-1-201ENST00000390357 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.04■■□□□ 1.44
TRBV4-1-201ENST00000390357 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
TRBV4-1-201ENST00000390357 SYNJ2O15056 1496 aa24■■□□□ 1.43
TRBV4-1-201ENST00000390357 TOP2BQ02880 1626 aa23.98■■□□□ 1.43
TRBV4-1-201ENST00000390357 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.98■■□□□ 1.43
TRBV4-1-201ENST00000390357 SYNJ1O43426 1573 aa23.97■■□□□ 1.43
TRBV4-1-201ENST00000390357 PBRM1Q86U86 1689 aa23.96■■□□□ 1.43
TRBV4-1-201ENST00000390357 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.96■■□□□ 1.43
TRBV4-1-201ENST00000390357 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.94■■□□□ 1.42
TRBV4-1-201ENST00000390357 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.89■■□□□ 1.41
TRBV4-1-201ENST00000390357 ARAP1Q96P48 1450 aa23.81■■□□□ 1.4
TRBV4-1-201ENST00000390357 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.78■■□□□ 1.4
TRBV4-1-201ENST00000390357 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.76■■□□□ 1.39
TRBV4-1-201ENST00000390357 GRIN2AQ12879 1464 aa23.76■■□□□ 1.39
TRBV4-1-201ENST00000390357 ADAMTS12P58397 1594 aa23.72■■□□□ 1.39
TRBV4-1-201ENST00000390357 NUP160Q12769 1436 aa23.68■■□□□ 1.38
TRBV4-1-201ENST00000390357 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TRBV4-1-201ENST00000390357 CEP170Q5SW79 1584 aa23.61■■□□□ 1.37
TRBV4-1-201ENST00000390357 KIF27Q86VH2 1401 aa23.57■■□□□ 1.36
TRBV4-1-201ENST00000390357 SHROOM2Q13796 1616 aa23.55■■□□□ 1.36
TRBV4-1-201ENST00000390357 JPH4Q96JJ6 628 aa23.53■■□□□ 1.36
TRBV4-1-201ENST00000390357 IGF1RP08069 1367 aa23.52■■□□□ 1.36
TRBV4-1-201ENST00000390357 CUL7Q14999 1698 aa23.46■■□□□ 1.35
TRBV4-1-201ENST00000390357 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.45■■□□□ 1.34
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