Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1SQ13698 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CACNA1SQ13698 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
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