RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556705.5

SRP54-AS1-204, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 580 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.56■■■□□ 2.8
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.04■■■□□ 2.24
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ABCC9O60706 1549 aa28.65■■■□□ 2.18
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.43■■□□□ 1.98
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.34■■□□□ 1.97
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NACADO15069 1562 aa27.34■■□□□ 1.97
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.08■■□□□ 1.93
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.92■■□□□ 1.9
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.9■■□□□ 1.9
SRP54-AS1-204ENST00000556705 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.66■■□□□ 1.86
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.56■■□□□ 1.84
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SCRIBQ14160 1630 aa26.5■■□□□ 1.83
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.25■■□□□ 1.79
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.92■■□□□ 1.74
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.75■■□□□ 1.71
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.36■■□□□ 1.65
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SMARCA4P51532 1647 aa25.32■■□□□ 1.64
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NCAPD3P42695 1498 aa25.24■■□□□ 1.63
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.23■■□□□ 1.63
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SMARCA2P51531 1590 aa25.16■■□□□ 1.62
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.12■■□□□ 1.61
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HMGXB3Q12766 1538 aa25.07■■□□□ 1.6
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.05■■□□□ 1.6
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SRP54-AS1-204ENST00000556705 WIZO95785 1651 aa24.86■■□□□ 1.57
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NESP48681 1621 aa24.75■■□□□ 1.55
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ERCC6Q03468 1493 aa24.67■■□□□ 1.54
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.61■■□□□ 1.53
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.5■■□□□ 1.51
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CUX2O14529 1486 aa24.48■■□□□ 1.51
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.46■■□□□ 1.51
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.44■■□□□ 1.5
SRP54-AS1-204ENST00000556705 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CFTRP13569 1480 aa24.3■■□□□ 1.48
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.26■■□□□ 1.47
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.21■■□□□ 1.47
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.21■■□□□ 1.47
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.19■■□□□ 1.46
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PRDM2Q13029 1718 aa24.15■■□□□ 1.46
SRP54-AS1-204ENST00000556705 WDR62O43379 1518 aa24.14■■□□□ 1.45
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.04■■□□□ 1.44
SRP54-AS1-204ENST00000556705 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TOPBP1Q92547 1522 aa23.82■■□□□ 1.4
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ABCC8Q09428 1581 aa23.76■■□□□ 1.39
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.76■■□□□ 1.39
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IFT140Q96RY7 1462 aa23.69■■□□□ 1.38
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SRP54-AS1-204ENST00000556705 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CUX1P39880 1505 aa23.57■■□□□ 1.36
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.52■■□□□ 1.36
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.51■■□□□ 1.35
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SOGA1O94964 1423 aa23.5■■□□□ 1.35
SRP54-AS1-204ENST00000556705 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.351e-6■■■■□ 25.1
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OSCARQ8IYS5 282 aa23.47■■□□□ 1.35
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SRP54-AS1-204ENST00000556705 WDR97A6NE52 1622 aa23.34■■□□□ 1.33
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CHD1O14646 1710 aa23.33■■□□□ 1.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.3■■□□□ 1.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TOP2BQ02880 1626 aa23.3■■□□□ 1.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SYNJ1O43426 1573 aa23.29■■□□□ 1.32
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.26■■□□□ 1.31
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FBLN2P98095 1184 aa23.25■■□□□ 1.31
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.24■■□□□ 1.31
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GRIN2BQ13224 1484 aa23.23■■□□□ 1.31
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GAPVD1Q14C86 1478 aa23.22■■□□□ 1.31
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PBRM1Q86U86 1689 aa23.22■■□□□ 1.31
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.19■■□□□ 1.3
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRIM41Q8WV44 630 aa23.17■■□□□ 1.3
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.14■■□□□ 1.29
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.14■■□□□ 1.29
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.14■■□□□ 1.29
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SYNJ2O15056 1496 aa23.11■■□□□ 1.29
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARHGEF11O15085 1522 aa23.08■■□□□ 1.29
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.02■■□□□ 1.28
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ADAMTS12P58397 1594 aa22.98■■□□□ 1.27
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.97■■□□□ 1.27
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GRIN2AQ12879 1464 aa22.93■■□□□ 1.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.92■■□□□ 1.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.91■■□□□ 1.26
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ARAP1Q96P48 1450 aa22.89■■□□□ 1.25
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CEP170Q5SW79 1584 aa22.86■■□□□ 1.25
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NUP160Q12769 1436 aa22.84■■□□□ 1.25
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KIF27Q86VH2 1401 aa22.82■■□□□ 1.24
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IGF1RP08069 1367 aa22.8■■□□□ 1.24
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.72■■□□□ 1.23
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CUL7Q14999 1698 aa22.72■■□□□ 1.23
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