Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL357140.3-201ENST00000639753 1983 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 PRICKLE1-203ENST00000455697 4277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
NHLH2Q02577 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms