Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BEX3Q00994 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms