Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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CTBP2P56545 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CTBP2P56545 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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CTBP2P56545 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CTBP2P56545 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CTBP2P56545 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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