Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
SP6Q3SY56 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms