Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CDC37Q16543 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CDC37Q16543 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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