Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFC1P60507 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFC1P60507 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVFC1P60507 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms