Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CDK8P49336 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CDK8P49336 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK8P49336 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK8P49336 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK8P49336 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK8P49336 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK8P49336 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CDK8P49336 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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