Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNT1P13805 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNT1P13805 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms