Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1G-209ENST00000502264 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1G-221ENST00000510115 6912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 DYSF-209ENST00000410041 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms