RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449934.6

MICA-209, Transcript of MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MICA, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICA-209ENST00000449934 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.24■■■■■ 4.67
MICA-209ENST00000449934 ABCC9O60706 1549 aa40.1■■■■■ 4.01
MICA-209ENST00000449934 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.78■■■■□ 3.96
MICA-209ENST00000449934 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.01■■■■□ 3.68
MICA-209ENST00000449934 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.75■■■■□ 3.63
MICA-209ENST00000449934 NACADO15069 1562 aa37.66■■■■□ 3.62
MICA-209ENST00000449934 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.66■■■■□ 3.62
MICA-209ENST00000449934 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.33■■■■□ 3.57
MICA-209ENST00000449934 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.18■■■■□ 3.54
MICA-209ENST00000449934 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.99■■■■□ 3.51
MICA-209ENST00000449934 BICRAQ9NZM4 1560 aa36.87■■■■□ 3.49
MICA-209ENST00000449934 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.6■■■■□ 3.45
MICA-209ENST00000449934 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.46■■■■□ 3.43
MICA-209ENST00000449934 SCRIBQ14160 1630 aa36.33■■■■□ 3.41
MICA-209ENST00000449934 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.28■■■■□ 3.4
MICA-209ENST00000449934 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.17■■■■□ 3.38
MICA-209ENST00000449934 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.1■■■■□ 3.37
MICA-209ENST00000449934 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
MICA-209ENST00000449934 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.81■■■■□ 3.16
MICA-209ENST00000449934 NCAPD3P42695 1498 aa34.75■■■■□ 3.15
MICA-209ENST00000449934 ERCC6Q03468 1493 aa34.65■■■■□ 3.14
MICA-209ENST00000449934 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.65■■■■□ 3.14
MICA-209ENST00000449934 SMARCA4P51532 1647 aa34.58■■■■□ 3.13
MICA-209ENST00000449934 CUX2O14529 1486 aa34.55■■■■□ 3.12
MICA-209ENST00000449934 SMARCA2P51531 1590 aa34.55■■■■□ 3.12
MICA-209ENST00000449934 HMGXB3Q12766 1538 aa34.48■■■■□ 3.11
MICA-209ENST00000449934 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
MICA-209ENST00000449934 NESP48681 1621 aa34.36■■■■□ 3.09
MICA-209ENST00000449934 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
MICA-209ENST00000449934 PEG3Q9GZU2 1588 aa34.17■■■■□ 3.06
MICA-209ENST00000449934 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.12■■■■□ 3.05
MICA-209ENST00000449934 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.03■■■■□ 3.04
MICA-209ENST00000449934 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
MICA-209ENST00000449934 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa33.92■■■■□ 3.02
MICA-209ENST00000449934 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.88■■■■□ 3.01
MICA-209ENST00000449934 WIZO95785 1651 aa33.74■■■□□ 2.99
MICA-209ENST00000449934 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.73■■■□□ 2.99
MICA-209ENST00000449934 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.58■■■□□ 2.97
MICA-209ENST00000449934 WDR62O43379 1518 aa33.48■■■□□ 2.95
MICA-209ENST00000449934 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.43■■■□□ 2.94
MICA-209ENST00000449934 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.38■■■□□ 2.93
MICA-209ENST00000449934 TRIM41Q8WV44 630 aa33.34■■■□□ 2.93
MICA-209ENST00000449934 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.32■■■□□ 2.92
MICA-209ENST00000449934 CFTRP13569 1480 aa33.27■■■□□ 2.92
MICA-209ENST00000449934 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.24■■■□□ 2.91
MICA-209ENST00000449934 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.09■■■□□ 2.89
MICA-209ENST00000449934 OSCARQ8IYS5 282 aa33.02■■■□□ 2.88
MICA-209ENST00000449934 PRDM2Q13029 1718 aa32.97■■■□□ 2.87
MICA-209ENST00000449934 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.9■■■□□ 2.86
MICA-209ENST00000449934 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
MICA-209ENST00000449934 IFT140Q96RY7 1462 aa32.74■■■□□ 2.83
MICA-209ENST00000449934 TOPBP1Q92547 1522 aa32.71■■■□□ 2.83
MICA-209ENST00000449934 ABCC8Q09428 1581 aa32.6■■■□□ 2.81
MICA-209ENST00000449934 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.59■■■□□ 2.81
MICA-209ENST00000449934 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.59■■■□□ 2.81
MICA-209ENST00000449934 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.59■■■□□ 2.81
MICA-209ENST00000449934 DNMBPQ6XZF7 1577 aa32.56■■■□□ 2.8
MICA-209ENST00000449934 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
MICA-209ENST00000449934 ARHGEF11O15085 1522 aa32.46■■■□□ 2.79
MICA-209ENST00000449934 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.44■■■□□ 2.788e-7■■■□□ 16.1
MICA-209ENST00000449934 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.41■■■□□ 2.78
MICA-209ENST00000449934 CHD1O14646 1710 aa32.38■■■□□ 2.77
MICA-209ENST00000449934 FBLN2P98095 1184 aa32.38■■■□□ 2.77
MICA-209ENST00000449934 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.36■■■□□ 2.77
MICA-209ENST00000449934 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.32■■■□□ 2.76
MICA-209ENST00000449934 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.28■■■□□ 2.76
MICA-209ENST00000449934 SOGA1O94964 1423 aa32.24■■■□□ 2.75
MICA-209ENST00000449934 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.22■■■□□ 2.75
MICA-209ENST00000449934 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.14■■■□□ 2.74
MICA-209ENST00000449934 ARAP1Q96P48 1450 aa32.11■■■□□ 2.73
MICA-209ENST00000449934 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.09■■■□□ 2.73
MICA-209ENST00000449934 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.07■■■□□ 2.73
MICA-209ENST00000449934 CUX1P39880 1505 aa32.06■■■□□ 2.72
MICA-209ENST00000449934 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.04■■■□□ 2.72
MICA-209ENST00000449934 WDR97A6NE52 1622 aa32.02■■■□□ 2.72
MICA-209ENST00000449934 GRIN2BQ13224 1484 aa31.96■■■□□ 2.71
MICA-209ENST00000449934 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
MICA-209ENST00000449934 SYNJ1O43426 1573 aa31.94■■■□□ 2.7
MICA-209ENST00000449934 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.93■■■□□ 2.7
MICA-209ENST00000449934 SYNJ2O15056 1496 aa31.87■■■□□ 2.69
MICA-209ENST00000449934 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
MICA-209ENST00000449934 PBRM1Q86U86 1689 aa31.85■■■□□ 2.69
MICA-209ENST00000449934 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.83■■■□□ 2.69
MICA-209ENST00000449934 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.72■■■□□ 2.67
MICA-209ENST00000449934 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.7■■■□□ 2.67
MICA-209ENST00000449934 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.59■■■□□ 2.65
MICA-209ENST00000449934 GRIN2AQ12879 1464 aa31.54■■■□□ 2.64
MICA-209ENST00000449934 ADAMTS12P58397 1594 aa31.49■■■□□ 2.63
MICA-209ENST00000449934 TOP2BQ02880 1626 aa31.49■■■□□ 2.63
MICA-209ENST00000449934 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.49■■■□□ 2.63
MICA-209ENST00000449934 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.47■■■□□ 2.63
MICA-209ENST00000449934 CEP170Q5SW79 1584 aa31.44■■■□□ 2.62
MICA-209ENST00000449934 NUP160Q12769 1436 aa31.4■■■□□ 2.62
MICA-209ENST00000449934 FHAD1B1AJZ9 1412 aa31.39■■■□□ 2.62
MICA-209ENST00000449934 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.32■■■□□ 2.6
MICA-209ENST00000449934 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
MICA-209ENST00000449934 SHROOM2Q13796 1616 aa31.29■■■□□ 2.6
MICA-209ENST00000449934 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
MICA-209ENST00000449934 JPH4Q96JJ6 628 aa31.16■■■□□ 2.58
MICA-209ENST00000449934 KIF13AQ9H1H9 1805 aa31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms