Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U1

ACTR3B, Actin-related protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3BQ9P1U1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ACTR3BQ9P1U1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTR3BQ9P1U1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms