Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ROPN1BQ9BZX4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ROPN1BQ9BZX4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROPN1BQ9BZX4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms