Protein–RNA interactions for Protein: P20226

TBP, TATA-box-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBPP20226 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TBPP20226 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TBPP20226 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TBPP20226 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TBPP20226 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TBPP20226 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TBPP20226 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TBPP20226 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBPP20226 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBPP20226 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBPP20226 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBPP20226 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TBPP20226 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TBPP20226 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TBPP20226 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TBPP20226 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBPP20226 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBPP20226 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBPP20226 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBPP20226 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBPP20226 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBPP20226 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBPP20226 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBPP20226 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TBPP20226 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TBPP20226 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBPP20226 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TBPP20226 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TBPP20226 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TBPP20226 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBPP20226 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBPP20226 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBPP20226 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBPP20226 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBPP20226 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBPP20226 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBPP20226 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBPP20226 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBPP20226 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBPP20226 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBPP20226 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TBPP20226 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms