RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521452.1

TMEM200B-202, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-202ENST00000521452 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.62■■■■■ 4.57
TMEM200B-202ENST00000521452 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.71■■■■□ 3.63
TMEM200B-202ENST00000521452 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
TMEM200B-202ENST00000521452 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.94■■■■□ 3.5
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.74■■■■□ 3.47
TMEM200B-202ENST00000521452 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.37■■■■□ 3.41
TMEM200B-202ENST00000521452 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.21■■■■□ 3.39
TMEM200B-202ENST00000521452 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.16■■■■□ 3.38
TMEM200B-202ENST00000521452 HRCP23327 699 aa35.7■■■■□ 3.3
TMEM200B-202ENST00000521452 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.66■■■■□ 3.3
TMEM200B-202ENST00000521452 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.54■■■■□ 3.28
TMEM200B-202ENST00000521452 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.26■■■■□ 3.24
TMEM200B-202ENST00000521452 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC9O60706 1549 aa34.91■■■■□ 3.18
TMEM200B-202ENST00000521452 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.73■■■■□ 3.15
TMEM200B-202ENST00000521452 SCRIBQ14160 1630 aa34.72■■■■□ 3.15
TMEM200B-202ENST00000521452 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.67■■■■□ 3.14
TMEM200B-202ENST00000521452 TRIM41Q8WV44 630 aa34.51■■■■□ 3.11
TMEM200B-202ENST00000521452 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.4■■■■□ 3.1
TMEM200B-202ENST00000521452 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
TMEM200B-202ENST00000521452 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.14■■■■□ 3.06
TMEM200B-202ENST00000521452 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.12■■■■□ 3.05
TMEM200B-202ENST00000521452 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.99■■■■□ 3.03
TMEM200B-202ENST00000521452 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
TMEM200B-202ENST00000521452 NACADO15069 1562 aa33.97■■■■□ 3.03
TMEM200B-202ENST00000521452 WIZO95785 1651 aa33.81■■■■□ 3
TMEM200B-202ENST00000521452 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
TMEM200B-202ENST00000521452 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
TMEM200B-202ENST00000521452 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
TMEM200B-202ENST00000521452 ABCC8Q09428 1581 aa33.25■■■□□ 2.91
TMEM200B-202ENST00000521452 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.22■■■□□ 2.91
TMEM200B-202ENST00000521452 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
TMEM200B-202ENST00000521452 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
TMEM200B-202ENST00000521452 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
TMEM200B-202ENST00000521452 SMARCA4P51532 1647 aa33.12■■■□□ 2.89
TMEM200B-202ENST00000521452 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP33.11■■■□□ 2.89
TMEM200B-202ENST00000521452 SMARCA2P51531 1590 aa33.07■■■□□ 2.88
TMEM200B-202ENST00000521452 SOGA1O94964 1423 aa33.04■■■□□ 2.88
TMEM200B-202ENST00000521452 CEP162Q5TB80 1403 aa33.01■■■□□ 2.88
TMEM200B-202ENST00000521452 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.99■■■□□ 2.87
TMEM200B-202ENST00000521452 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.89■■■□□ 2.86
TMEM200B-202ENST00000521452 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.88■■■□□ 2.85
TMEM200B-202ENST00000521452 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.87■■■□□ 2.85
TMEM200B-202ENST00000521452 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.87■■■□□ 2.85
TMEM200B-202ENST00000521452 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
TMEM200B-202ENST00000521452 EEA1Q15075 1411 aa32.76■■■□□ 2.83
TMEM200B-202ENST00000521452 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
TMEM200B-202ENST00000521452 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.74■■■□□ 2.83
TMEM200B-202ENST00000521452 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP32.71■■■□□ 2.83
TMEM200B-202ENST00000521452 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
TMEM200B-202ENST00000521452 NEUROD1Q13562 356 aa32.67■■■□□ 2.82
TMEM200B-202ENST00000521452 GOLGA3Q08378 1498 aa32.62■■■□□ 2.81
TMEM200B-202ENST00000521452 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.5■■■□□ 2.79
TMEM200B-202ENST00000521452 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
TMEM200B-202ENST00000521452 SYNJ1O43426 1573 aa32.41■■■□□ 2.78
TMEM200B-202ENST00000521452 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.4■■■□□ 2.78
TMEM200B-202ENST00000521452 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.39■■■□□ 2.78
TMEM200B-202ENST00000521452 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP32.37■■■□□ 2.77
TMEM200B-202ENST00000521452 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa32.37■■■□□ 2.77
TMEM200B-202ENST00000521452 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
TMEM200B-202ENST00000521452 CLIP1P30622 1438 aa32.33■■■□□ 2.77
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF21BO75037 1637 aa32.28■■■□□ 2.76
TMEM200B-202ENST00000521452 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.24■■■□□ 2.75
TMEM200B-202ENST00000521452 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.23■■■□□ 2.75
TMEM200B-202ENST00000521452 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.2■■■□□ 2.74
TMEM200B-202ENST00000521452 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.19■■■□□ 2.74
TMEM200B-202ENST00000521452 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
TMEM200B-202ENST00000521452 APLP2Q06481 763 aa32.15■■■□□ 2.74
TMEM200B-202ENST00000521452 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP32.08■■■□□ 2.73
TMEM200B-202ENST00000521452 MIER1Q8N108 512 aa32.02■■■□□ 2.72
TMEM200B-202ENST00000521452 TOP2BQ02880 1626 aa31.92■■■□□ 2.7
TMEM200B-202ENST00000521452 PRXQ9BXM0 1461 aa31.76■■■□□ 2.68
TMEM200B-202ENST00000521452 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.75■■■□□ 2.67
TMEM200B-202ENST00000521452 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.74■■■□□ 2.67
TMEM200B-202ENST00000521452 ARAP1Q96P48 1450 aa31.73■■■□□ 2.67
TMEM200B-202ENST00000521452 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.71■■■□□ 2.67
TMEM200B-202ENST00000521452 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
TMEM200B-202ENST00000521452 CLSPNQ9HAW4 1339 aa31.62■■■□□ 2.65
TMEM200B-202ENST00000521452 CUX1P39880 1505 aa31.6■■■□□ 2.65
TMEM200B-202ENST00000521452 KIF27Q86VH2 1401 aa31.55■■■□□ 2.64
TMEM200B-202ENST00000521452 NCAPD3P42695 1498 aa31.51■■■□□ 2.63
TMEM200B-202ENST00000521452 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
TMEM200B-202ENST00000521452 HMGXB3Q12766 1538 aa31.46■■■□□ 2.63
TMEM200B-202ENST00000521452 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa31.41■■■□□ 2.62
TMEM200B-202ENST00000521452 ITGAEP38570 1179 aa31.41■■■□□ 2.62
TMEM200B-202ENST00000521452 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.39■■■□□ 2.62
TMEM200B-202ENST00000521452 CFTRP13569 1480 aa31.39■■■□□ 2.62
TMEM200B-202ENST00000521452 CUX2O14529 1486 aa31.3■■■□□ 2.6
TMEM200B-202ENST00000521452 IGF1RP08069 1367 aa31.23■■■□□ 2.59
TMEM200B-202ENST00000521452 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa31.18■■■□□ 2.58
TMEM200B-202ENST00000521452 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.09■■■□□ 2.57
TMEM200B-202ENST00000521452 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
TMEM200B-202ENST00000521452 TIAM1Q13009 1591 aa31.07■■■□□ 2.57
TMEM200B-202ENST00000521452 MAPKBP1O60336 1514 aa31.06■■■□□ 2.56
TMEM200B-202ENST00000521452 MYT1Q01538 1121 aa31.05■■■□□ 2.56
TMEM200B-202ENST00000521452 PHLDB1Q86UU1 1377 aa31.02■■■□□ 2.56
TMEM200B-202ENST00000521452 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.01■■■□□ 2.55
TMEM200B-202ENST00000521452 CADPSQ9ULU8 1353 aa31■■■□□ 2.55
TMEM200B-202ENST00000521452 KCNH8Q96L42 1107 aa31■■■□□ 2.55
TMEM200B-202ENST00000521452 SETD5Q9C0A6 1442 aa31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms