Protein–RNA interactions for Protein: O43182

ARHGAP6, Rho GTPase-activating protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP6O43182 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARHGAP6O43182 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP6O43182 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP6O43182 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP6O43182 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP6O43182 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP6O43182 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP6O43182 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP6O43182 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP6O43182 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms