Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LMBR1LQ6UX01 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms