Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RNF182Q8N6D2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RNF182Q8N6D2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms