Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MROH7-204ENST00000409996 2977 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 MCM3-202ENST00000419835 2523 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PCDH20-201ENST00000409204 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PTCHD1-201ENST00000379361 13714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 CACNA2D3-AS1-201ENST00000471265 2078 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PCDHA10-202ENST00000506939 3788 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
VAMP3Q15836 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PIK3C2B-204ENST00000424712 7522 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AL118505.1-201ENST00000619370 1932 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PLSCR1-201ENST00000342435 2233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 OR10H5-202ENST00000642092 7044 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 EPB41L4A-201ENST00000261486 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SEC16A-203ENST00000313050 8806 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PRPH2-201ENST00000230381 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 FOSB-204ENST00000585836 3550 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ITGA4-203ENST00000397033 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LAMB3-202ENST00000367030 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 CLGN-201ENST00000325617 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LAMA4-219ENST00000522006 6438 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 ATP2C2-201ENST00000262429 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VAMP3Q15836 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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