Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTPN12Q05209 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms