Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
REG3AQ06141 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
REG3AQ06141 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms