Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC142Q17RM4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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