Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TAF6P49848 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TAF6P49848 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms